Der Projektunterricht ist ein wesentlicher Bestandteil der Arbeit in den Jahrgängen 5 und 6, dafür werden 6 Stunden in der Woche dafür zur Verfügung gestellt. Unterrichtet werden die Schülerinnen und Schüler von ihren Klassenlehrerinnen und Klassenlehrern. Neben der Vermittlung fachlicher Inhalte ist es Aufgabe des Projektunterrichts, den Schülerinnen und Schülern im Projekt „Lernen lernen“ (Jahrgang 5) die nötigen Kompetenzen zum selbstständigen Lernen zu vermitteln. Am Ende des Projektes wird den Schülerinnen und Schülern die erfolgreiche Teilnahme durch ein Zertifikat bestätigt.
Im Jahrgang 6 werden die Schülerinnen und Schüler noch intensiver im Bereich des selbstständigen Lernens ausgebildet. Hier geht es unter anderem um Selbstorganisation, Zuverlässigkeit, Leistungswillen und Methodensicherheit. Auch diese Anforderungen werden durch ein schulisches Zertifikat ausgezeichnet. Wenn die Schülerinnen und Schüler das Zertifikat „Selbstständige/r Lerner/in“ erhalten, dürfen sie in Gruppenarbeitsphasen oder bei Projekten den eigenen Lernort mitbestimmen.